蛋白质纯化，是从混合物样本中，基于不同蛋白质物理化学性质差异的原理，分离纯化目标蛋白质的技术，目的是提供高纯度目标蛋白质，以进行进一步的研究与应用。
　　生物样本通常是多种生物分子的混合物，包括蛋白质、核酸、多肽、多糖等，一个真核细胞中通常包含几千种不同蛋白质，为避免干扰、研究目标蛋白质，必须采用蛋白质纯化技术。蛋白质种类繁多，存在一定的相似性，与其他生物分子差别明显，基于此可去除非蛋白物质，不同种类的蛋白质之间存在差异性，基于此可分离提取目标蛋白质。
　　蛋白质纯化可基于蛋白质的大小、疏水性、溶解度、电荷、亲和性等特性进行，技术方案多样。基于大小的蛋白质纯化方法有超滤法、凝胶过滤法；基于溶解度的蛋白质纯化方法有盐析法、等电点沉淀法；基于电荷的蛋白质纯化方法有离子交换层析法、电泳法。
　　蛋白质纯化步骤一般包括预处理、粗分级、细分级三大步。预处理是细胞破碎；粗分级通常采用盐析法、等电点沉淀法、有机溶剂沉淀法、超滤法、凝胶过滤法等方法，得到的蛋白质含有杂质；细分级通常采用凝胶过滤层析法、离子交换层析法、亲和层析法、电泳法等，得到高纯度目标蛋白质。
　　蛋白质纯化应用领域极为广阔，包括生物学、医学、药学、食品科学、环境科学、科研、教育等。蛋白质纯化在生物学领域，可用于抗体纯化、宿主细胞蛋白分析等方面；在医学领域，可用于疾病诊断、药物筛选等方面；在药学领域，可用于生产高纯度、高活性药物蛋白；在环境科学领域，可用于水质监测、大气监测等方面。
　　在生物学、医学、药学等技术快速发展推动下，全球蛋白质纯化市场需求不断增加。2023年，全球蛋白质纯化市场规模约为682.9亿元；预计到2029年，全球蛋白质纯化市场规模将达到1108.0亿元；2023-2029年，全球蛋白质纯化市场年复合增长率为8.4%。
　　蛋白质纯化技术方案多样，进入布局企业不断增多，全球范围内代表性企业主要有美国赛默飞世尔（Thermo Fisher）、美国伯乐（Bio-Rad Laboratories）、美国安捷伦（Aglient）、美国思拓凡（Cytiva）、美国GE医疗、美国普洛麦格（Promega）、美国金斯瑞（GenScript）、德国默克集团（Merck KGaA）、德国QIAGEN等。