核酸探针，也称基因探针，是被标记的、与待测基因互补的核酸序列，是生物探针中最常见的产品类型，狭义上的生物探针就是指核酸探针。
　　核酸探针包括DNA探针、RNA探针两大类。同源性的核酸单链可互补形成双链，基于此原理，核酸探针与目标基因可发生特异性作用，通过杂交与目的基因结合。对双链核酸序列进行变性处理形成单链，选择单链DNA或者RNA片段，利用标记物进行标记，与目标基因进行杂交结合形成双链，利用标记物的自显影或发光效果，将目的基因显示出来。
　　核酸探针进行标记目的是获得可识别信号，进而显示目的基因，方法包括放射性同位素标记、非放射性同位素标记两大类。放射性同位素可发射射线，具有自显影效果，常见的产品主要是磷-32（32P）。非放射性同位素标记又包括酶标记、化学标记两种。酶标记具有酶联化学发光效果，常见的产品有生物素、地高辛等。化学标记常见的产品是荧光染料，具有荧光发光效果。
　　从细分产品来看，DNA探针可采用单链DNA或者将双链DNA高温变性形成单链，具有制备方法简单、标记方法成熟、不易降解、可有效抑制DNA酶活性等优点，是现阶段最为常见的核酸探针，可用于科研与检测领域。RNA探针又包括cDNA探针、cRNA探针、寡核苷酸探针三种，都是单链RNA，主要用于科研领域。
　　利用核酸探针，可以检测目标基因是否存在，以及存在的数量、位置，可以应用在生命科学、临床医学领域，实现疾病机制研究、疾病诊断与治疗。在疾病诊疗领域，核酸探针可配合SERS（表面增强拉曼光谱）用来精准诊断恶性肿瘤，具有非入侵、高灵敏度优点，因此受到关注。
　　在全球范围内，核酸探针提供商主要有瑞士罗氏（Roche）、美国Sigma-Aldrich、美国Empire Genomics、美国普洛麦格（Promega）、英国Bioline等。
　　根据世界卫生组织国际癌症研究机构（IARC）公布数据显示，2020年，中国新发癌症病例达到457万例。2023年，中国新发癌症病例数超过400万例，死亡病例超过240万例。在此背景下，癌症早发现、早治疗重要性突出，我国核酸探针发展空间巨大。受此影响，我国核酸探针研制步伐正在不断加快。